生物人教版 (2019)第2节 基因工程的基本操作程序精品课件ppt
展开Basic perating prcedures fr genetic engineering
DNA片段的扩增与鉴定
DNA片段的PCR扩增
PCR amplificatin f DNA fragments
根据DNA半保留复制的原理,在体外提供参与DNA复制的各种组分与反应条件,对目的基因的核苷酸序列进行大量复制的技术。
解开螺旋形成的两条单链
断开氢键打开DNA双链
利用水解ATP获得能量
调节温度控制DNA解聚与结合
使用DNA聚合酶能够从引物的3’端开始连接脱氧核苷酸
能与DNA母链的一段碱基序列互补配对
Mg2+激活DNA聚合酶
维持反应体系的pHMg2+激活DNA聚合酶
温度上升到90℃以上,双链DNA解旋为单链
温度下降到50℃左右,两种引物与两条单链DNA结合
温度上升到72℃左右,缓冲液中的脱氧核苷酸在耐高温DNA聚合酶的催化作用下合成新的DNA链
DNA数量以指数方式增加
至少扩增3次获得目的基因
思考:PCR技术最终哪部分被大量复制了
成对的引物应位于目的基因两侧
引物自身不应存在互补序列等
引物之间不应存在互补序列等
防止引物之间配对,导致引物不能与模板链结合
引物类似于书签,指示聚合酶从特定位置开始复制,从而仅对DNA上的特定片段进行扩增
思考:用PCR可以扩增mRNA吗?
mRNA不可以直接扩增,需要将它逆转录成cDNA再进行扩增。
1.逆转录酶以RNA为模板合成一条与RNA互补的DNA链,形成RNA-DNA杂交分子
2.核酸酶H降解RNA-DNA杂交分子中的RNA链,使之变成单链DNA
3.以单链DNA为模板,在DNA聚合酶的作用下合成另一条互补的DNA链,形成双链DNA分子
核酸(DNA或RNA)检测
①模板: 需要脱氧核苷酸双链作为模板②原料: 以四种脱氧核苷酸为原料③酶: 需要DNA聚合酶④引物: 使DNA聚合酶从引物开始进行互补链的合成
解旋酶、DNA聚合酶等
控制温度需在不同温度下进行
1. 判断(1) PCR要根据目的基因全部的核苷酸序列设计引物 ( )(2) PCR除需要耐热的DNA聚合酶、解旋酶、4种脱氧核苷酸和DNA模板外,还需要引物等基本条件。 ( )(3) DNA聚合酶不能从头开始合成DNA,而只能从引物的3′端延伸DNA链 ( )(4) 高温变性过程中被切断的是DNA分子内碱基对之间的氢键( )(5) PCR复性的目的是使原来分开的DNA的两条单链重新连接成双链( )(6) PCR 过程中只需要两个引物分子( )
2. 利用 PCR 技术扩增目的基因,其原理与细胞内 DNA 复制类似(如图所示)。图中引物为单链 DNA 片段,它是子链合成延伸的基础。下列叙述错误的是 ( )
A. 由原来的母链为模板合成的两个新DNA分子中,只含有引物A或引物BB. 第四轮循环产物中同时含有引物 A 和引物 B 的 DNA 片段所占的比例为1/8C. 复性温度过高可能导致 PCR 反应得不到任何扩增产物D. 设计引物时需要避免引物之间形成碱基互补配对而造成引物自连
3. X基因”是DNA分子上一个有遗传效应的片段,若要用PCR技术特异性地拷贝“X基因”,需在PCR反应中加入两种引物(注:引物的作用是与模板链形成双链后在DNA聚合酶的作用下就可以继续链的延伸),两种引物及其与模板链的结合位置如下图甲所示。经4轮循环后产物中有五种不同的DNA分子,如下图乙所示,其中第⑤种DNA分子有( )
A. 8个 B. 6个 C. 4个 D. 2个
4. 在表达融合蛋白时可以利用融合PCR技术把两个不同的基因片段连接起来,其原理如图所示,下列分析正确的是( )A.该过程使用的引物P2和P3的碱基完全互补配对,所以不能放在一个 系统中工作B.融合PCR的第一步需要加入耐高温DNA聚合酶、DNA连接酶等C.融合PCR的第一步是不需要引物的,可能是因为两条链重叠的部位互为另一条链的引物D.若融合PCR的第二步获得了64个融合基因,则该过程消耗了128个引物
DNA fragment identificatin
在电场作用下,带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程称为电泳
在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷
DNA分子具有可解离的基团
凝胶中DNA分子的迁移速率
DNA分子通过染色,可以在波长为300nm的紫外灯下被检测出来
根据待分离DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%-1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀
低浓度用来进行大片段DNA电泳高浓度用来进行小片段DNA电泳
根据分离DNA片段大小配制琼脂糖溶液深度
在紫外光下发荧光,其荧光强度与DNA分子含量成正比
A.将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。
B.待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。
电泳前将DNA溶液由加样孔加入
C.将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜
维持电泳时PH,并使溶液具有一定导电性,利于核酸迁移
将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物
增加PCR产物溶液密度,帮助样品沉降到点样孔的底部
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳
取出凝胶置于紫外灯下观察和照相
①为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。
②该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
③在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
④在进行操作时,一定要戴好一次性手套
⑤PCR扩增不能随意加大试剂用量
(1)你是否成功扩增出DNA片段?判断的依据是什么?
可以在紫外灯下直接观察到DNA条带的分布及粗细程度来评价扩增的结果。进行电泳鉴定的结果应该是一条条带。
(2)你进行电泳鉴定的结果是几条条带?如果不止一条条带,请分析产生这个结果的可能原因。
如果扩增不成功,可能的原因有:漏加了PCR的反应成分,各反应成分的用量不当,PCR程序设置不当等。如果扩增结果不止一条条带,可能的原因有:引物设计不合理,它们与非目的序列有同源性或容易形成二聚体;退火温度过低;DNA聚合酶的质量不好等。
1.下列关于DNA糖凝胶电泳表述正确的是 ( )A.凝胶融化时一定要充分加热,使凝胶溶液沸腾一会儿再停止加热,并立刻倒入制胶槽B.因上样缓冲液中含有指示剂,凝胶电泳后可直接观察到DNA条带C.不同长度的线性DNA分子具有不同的电泳迁移率D.长度相同的DNA分子电泳迁移率一致
2. 在基因工程操作中,科研人员利用两种限制酶(R1和R2)处理基因载体,进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,结果如图所示。以下相关叙述中,不正确的是( )
A.该载体最可能为环形DNA分子B.两种限制酶在载体上识别的序列可能相同C.限制酶R1与R2的切点最短相距约200bpD.限制酶作用位点会导致磷酸二酯键断裂
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